Е, добрый день!
Требования МУПа законны в том случае, если:
1. Ваше остекление мешает проведению ремонта балконной плиты верхнего этажа;
2. Ваша перепланировка (остекление балкона) не согласована в порядке, предусмотренном ст. 26 Жилищного Кодекса РФ.
Первая позиция основана на том, что балконная плита - есть общее имущество многоквартирного дома (подпункт "в", пункта 2 части 1 раздела 1 Правил содержания имущества в многоквартирном доме, утвержденных Постановлением Правительства РФ от 13.08.2006 № 491), обязанность по содержанию которого возложена на управляющую организацию (пункт 42 Правил). Вы должны были сделать остекление таким образом, что бы оно не нарушало законных прав и интересов третьих лиц, т.е. не мешало другим, в т.ч. и управляющей организации - МУПу исполнять возложенные на нее законом обязанности.
Что касается второй позиции, то в случае самовольного остекления (т.е. без законного согласования указанной перепланировки) Жилищная инспекция, руководствуясь п. 3 ст. 29 ЖК РФ, вправе потребовать от Вас привести балкон в прежнее состояние. В противном случае, суд, по иску Жилищной инспекции, обяжет Вас сделать то же самое.
Наличие ипотеки никоим образом не влияет на ситуацию, поскольку законным собственником квартиры и обязанным лицом в данной ситуации являетесь именно Вы.