Расчет пени по штрафам

В контракте согласована ответственность за просрочку исполнения поставщиком (обществом) обязательств в виде пени и за неисполнение им других, кроме просрочки, обязательств в виде штрафа. При этом по вопросам о порядке определения пени и о размере штрафа контракт отсылает к постановлению Правительства Российской Федерации от 25.11.2013 № 1063 «Об утверждении Правил определения размера штрафа, начисляемого в случае ненадлежащего исполнения заказчиком, поставщиком (подрядчиком, исполнителем) обязательств, предусмотренных контрактом (за исключением просрочки исполнения обязательств заказчиком, поставщиком (подрядчиком, исполнителем), и размера пени, начисляемой за каждый день просрочки исполнения поставщиком обязательства, предусмотренного контрактом». Если товар оказался некачественным, то как правильно рассчитать размер пеней и штрафа при нарушениях поставки?